其时吏科都给事中出缺，照年资推论，该一个姓周的迁补，其次是阮大铖，再次是魏大中。阮大铖想谋这个缺，活动到魏忠贤左右，请他发一道“中旨”，借故不准那姓周的迁补，好让他成为第一优先。赵南星知道了这件事，很讨厌他，于是援用规定，预备以阮大铖例行调任，连原来的给事中都将当不成。阮大铖疑心这是左光斗在捣鬼，因而结了怨，当然也恨魏大中。
另一方面，有熊明遇、徐良彦都补佥都御史，而赵南星引左光斗补这个缺，熊、徐二人跟左光斗又结了怨。至于魏大中则冤家更多。
魏大中是浙江嘉善人，受业于高攀龙，家里极穷，而不以穷为恶，慨然有天下之志；天启四年春间正当礼科的副长官左给事中。六科稽查六部，其时礼部请封荫恤典的奏疏甚多，这都是客、魏为了培植私人预先取得资格的一种手法，魏大中公事公办，多加裁抑，因而结了许多冤家。
最坏的是东林内部亦有以地域来分的派系，魏大中曾驳了苏松巡抚王象恒和刘一燝的弟弟浙江巡抚刘一焜的恤典，所以王的同乡山东人、刘的同乡江西人亦都对魏大中大为不满，其中有个江西人给事中章允儒性情尤其忮刻，必欲去魏大中而后快。
于是同恶相济，由阮大铖与章允儒定计，熊明遇、徐良彦等人一起教唆给事中傅櫆奏劾左光斗、魏大中与汪文言朋比为奸。魏忠贤大喜，当时把汪文言抓到镇抚司监狱。左光斗与魏大中则上疏自辩，御史袁化中等人纷纷申救，同时大学士叶向高因为汪文言是他所引进，所以引罪辞官。这正反两种手段的压力也很大，而且镇抚司刘侨又听了御史黄尊素的话，以为不宜兴起大狱，所以处理得很谨慎，只把汪文言办了廷杖褫职的罪名，其他无所株连。左光斗照旧供职，迁补了吏科都给事中的魏大中，亦准许履任。
京官到任，向例由鸿胪寺转奏报名，完全是备案性质，从无批谕。魏忠贤心有不甘，矫旨批复，说魏大中与傅櫆“互讦未竣，不得赴新任”，这个史无前例的举动，满朝诧异，甚至连傅櫆都替魏大中讲话。